По информации Комитета государственных доходов Министерства финансов Республики Казахстан, выписка электронных счетов-фактур будет обязательна для всех плательщиков НДС с 2017 года.

Положения Налогового кодекса, предусматривающие выписку счетов-фактур в электронном виде, введены в действие  в Казахстане с 1 июля 2014 года. В настоящее время выписка электронных счетов-фактур осуществляется на добровольной основе посредством информационной системы электронных счетов-фактур, администратором которой определен Комитет Казначейства Министерства финансов Республики Казахстан.   

Информационная система позволяет регистрировать как лиц, которые выписывают электронные счета-фактуры, так и их получателей, в том числе физических лиц.

По состоянию на начало октября 2015 года в информационной системе электронных счетов-фактур зарегистрировано свыше 25 тыс. пользователей системы, из них хозяйствующие субъекты составляют свыше 10 тыс., ими выписаны свыше 716 тыс. счетов-фактур.   

При разработке системы по желанию налогоплательщиков счет-фактура, являющийся основанием для отнесения в зачет сумм НДС, дополнен реквизитами первичных бухгалтерских документов, в частности, в счете-фактуре можно указать дополнительные сведения о грузополучателе, грузоотправителе, банковские реквизиты и т. д.

Преимуществами использования электронных счетов-фактур является существенное сокращение для пользователей ИС ЭСФ объема налоговой отчетности, представляемой по НДС. Так, в случае если поставщиком товаров, работ, услуг выписываются все счета-фактуры в электронном виде, не нужно будет предоставлять реестр по реализованным товарам, работам, услугам. В случае если получателю (покупателю) товаров, работ, услуг все счета-фактуры выписаны в электронном виде, не нужно будет предоставлять реестр по приобретенным товарам, работам, услугам.   

Кроме того, информационная система электронных счетов-фактур представляет интерес для лиц, работающих по договору о государственном закупе, поскольку позволяет государственному учреждению, которое является получателем товаров, работ, услуг , автоматически формировать счета на оплату в ИС «Казначейство – клиент» на основе электронного счета-фактуры, выписанного поставщиком в информационной системе электронных счетов-фактур.