В соответствии с подпунктом 3) пункта 8 статьи 194 Кодекса Республики Казахстан от 25.12.2017г. № 120-VI «О налогах и других обязательных платежах в бюджет» (Налоговый кодекс), при ведении раздельного налогового учета для исчисления налогового обязательства налогоплательщик (налоговый агент) обязан обеспечить представление налоговой отчетности по налогам и платежам в бюджет – в целом по всей деятельности, за исключением: декларации по корпоративному подоходному налогу; декларации по индивидуальному подоходному налогу; декларации по налогу на добавленную стоимость (далее – НДС) в случае, предусмотренном подпунктом 6) данного пункта.

Согласно подпункту 6) пункта 8 статьи 194 Налогового кодекса, представление отдельно декларации по НДС:

по деятельности, предусмотренной статьей 411 Налогового кодекса; по иной деятельности.

В соответствии с подпунктом 1) пункта 1 статьи 411 Налогового кодекса, следующие лица вправе относить в зачет дополнительную сумму НДС производители сельскохозяйственной продукции, продукции аквакультуры (рыбоводства), включая крестьянские или фермерские хозяйства, – по оборотам по реализации товаров, являющихся результатом осуществления деятельности по производству сельскохозяйственной продукции, продукции аквакультуры (рыбоводства), переработке указанной продукции собственного производства.

Положения данного пункта не распространяются на обороты по реализации подакцизных товаров и продуктов их переработки. Определение видов деятельности в целях применения настоящего пункта осуществляется в соответствии с Общим классификатором видов экономической деятельности, утвержденным государственным органом, осуществляющим государственное регулирование в области технического регулирования.

Согласно пункту 2 статьи 411 Налогового кодекса, налогоплательщики, указанные в пункте 1 данной статьи, вправе применять положения данной статьи при условии ведения раздельного учета: оборотов по реализации по деятельности, предусмотренной пунктом 1 данной статьи, и иной деятельности; подлежащих получению (полученных) товаров, работ, услуг, которые используются или будут использоваться в деятельности, предусмотренной пунктом 1 данной статьи, и иной деятельности.

Согласно подпункту 5) пункта 1 статьи 191 Налогового кодекса, в налоговой учетной политике выбранные налогоплательщиком методы отнесения на вычеты расходов в целях исчисления корпоративного подоходного налога, а также отнесения в зачет НДС. В соответствии с пунктом 1 статьи 407 Налогового кодекса, если иное не предусмотрено пунктом 2 данной статьи, плательщик НДС, кроме указанного в пункте 3 данной статьи, определяет сумму НДС, разрешенного к отнесению в зачет, одним из следующих методов: пропорциональным методом; через ведение раздельного учета сумм НДС по товарам, работам, услугам, которые используются или будут использоваться для целей облагаемого и необлагаемого оборотов.

Согласно пункту 1 статьи 409 Налогового кодекса, при определении суммы НДС, разрешенного к отнесению в зачет, через ведение раздельного учета плательщик НДС ведет раздельный учет сумм НДС по полученным товарам, работам, услугам, используемым для целей облагаемых и необлагаемых оборотов. На основании вышеизложенного, в случае если юридическое лицо, осуществляет деятельность, предусмотренную пунктом 1 статьи 411 Налогового кодекса и иную деятельность, не предусмотренную пунктом 1 статьи 411 Налогового кодекса, обязан вести раздельный учет с предоставлением отдельных Деклараций по НДС (форма 300.00) по деятельности предусмотренной пунктом 1 статьи 411 Налогового кодекса и иной деятельности. При этом метод отнесения суммы НДС в зачет определяется самостоятельно налогоплательщиком, в соответствии со статьей 407 Налогового кодекса.