Проектный офис: применение новых норм налогообложения в сфере здравоохранения
03-02-2026
2 февраля 2026 года на третьем заседании Проектного офиса по внедрению Налогового кодекса рассмотрены вопросы правоприменения новых налоговых норм в отношении лекарственных средств и медицинских изделий.

По словам заместителя председателя НПП «Атамекен», в настоящее время на практике возникла правовая неопределенность в подзаконных актах отраслевых государственных органов по вопросам импорта и розничной реализации через аптечные сети лекарственных средств, входящих в перечни ГОБМП и ОСМС, а также орфанных и социально значимых заболеваний. Поднят вопрос формирования предельных цен на лекарственные средства с учетом НДС или без него.

При таможенном оформлении импортных лекарственных средств таможенные органы требуют подтверждение целевого назначения по всем лекарственным средствам, входящим в указанные перечни. При этом такое требование является расширительным толкованием действующих правил и не предусмотрено для всех категорий ввозимых лекарств.

Заместитель председателя КГД МФ РК пояснил, что обязательными условиями при импорте всех лекарственных средств являются наличие лицензии на фармацевтическую или медицинскую деятельность, договоры поставки в рамках ГОБМП и ОСМС для лекарственных средств, поставляемых по государственному заказу, а также обязательства поставщика о целевом использовании товаров.

При импорте зарегистрированных лекарственных средств требуется государственная регистрация на территории РК, для незарегистрированныхразрешительный документ Министерства здравоохранения РК. При этом подтверждение целевого назначения необходимо исключительно при импорте лекарственных субстанций и балк-продуктов, используемых для производства на территории РК.

Решение Проектного офиса - в действующие правила будут внесены изменения, а уже в ближайшее время позиция по импорту лекарственных средств будет доведена до территориальных подразделений таможенных органов для применения в работе.

Второй блок вопросов касался освобождения от НДС лекарственных средств для лечения орфанных и социально значимых заболеваний. В настоящее время аптеки отказываются закупать такие препараты у поставщиков в связи с тем, что поставщики применяют ставки 5% и 16%, несмотря на то, что действующие правила предусматривают освобождение от НДС не только при импорте, но и при оптовой и розничной реализации. Данная норма направлена на обеспечение доступности социально значимых лекарств в широкой рознице.

Обсужден вопрос утверждения предельных цен на лекарственные средства и медицинские изделия – с учетом НДС или без него. При этом отмечено, что налогоплательщик вправе начислять НДС сверх предельной цены, поскольку она является верхним допустимым пределом, а не ценой фактической реализации.

Решение Проектного офиса - Комитет медицинского и фармацевтического контроля Министерства здравоохранения РК совместно с КГД МФ РК в короткие сроки выработают единую позицию и доведут ее до сведения фармацевтического сообщества.

Со стороны КГД МФ РК озвучен ряд дополнительных вопросов, связанных с применением норм по НДС, связанных с сферой здравоохранения, которые рассмотрены и в ближайшее время будут опубликованы на ресурсах КГД МФ РК для информирования бизнеса.

По материалам МНЭ РК